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~/配下にソースコードを落としてしまったのでやり直したい

まずはnpmのアンインストール

$ sudo npm uninstall npm -g

続いてnode.jsのアンンストール

$ cd ~/node
$ sudo make uninstall

簡単でした。よかった。これならアップデートとか更新とかそんなに心配しなくて大丈夫そう。